Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx17Q8BVL3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx17Q8BVL3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx17Q8BVL3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx17Q8BVL3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx17Q8BVL3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx17Q8BVL3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx17Q8BVL3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx17Q8BVL3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx17Q8BVL3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx17Q8BVL3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx17Q8BVL3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx17Q8BVL3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx17Q8BVL3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx17Q8BVL3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx17Q8BVL3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx17Q8BVL3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx17Q8BVL3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx17Q8BVL3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx17Q8BVL3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx17Q8BVL3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx17Q8BVL3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx17Q8BVL3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx17Q8BVL3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx17Q8BVL3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx17Q8BVL3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx17Q8BVL3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx17Q8BVL3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx17Q8BVL3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx17Q8BVL3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snx17Q8BVL3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx17Q8BVL3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
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