Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTF7

Lig4, DNA ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig4Q8BTF7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lig4Q8BTF7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lig4Q8BTF7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lig4Q8BTF7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lig4Q8BTF7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lig4Q8BTF7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lig4Q8BTF7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lig4Q8BTF7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lig4Q8BTF7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lig4Q8BTF7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lig4Q8BTF7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lig4Q8BTF7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lig4Q8BTF7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lig4Q8BTF7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lig4Q8BTF7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lig4Q8BTF7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lig4Q8BTF7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lig4Q8BTF7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lig4Q8BTF7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lig4Q8BTF7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lig4Q8BTF7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lig4Q8BTF7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lig4Q8BTF7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lig4Q8BTF7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lig4Q8BTF7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lig4Q8BTF7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lig4Q8BTF7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lig4Q8BTF7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lig4Q8BTF7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lig4Q8BTF7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lig4Q8BTF7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lig4Q8BTF7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lig4Q8BTF7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lig4Q8BTF7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms