Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
5730596B20RikQ8BQ08 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
5730596B20RikQ8BQ08 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms