Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPZ8

Abraxas1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abraxas1Q8BPZ8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Abraxas1Q8BPZ8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abraxas1Q8BPZ8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abraxas1Q8BPZ8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abraxas1Q8BPZ8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Abraxas1Q8BPZ8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abraxas1Q8BPZ8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abraxas1Q8BPZ8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abraxas1Q8BPZ8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abraxas1Q8BPZ8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abraxas1Q8BPZ8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abraxas1Q8BPZ8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abraxas1Q8BPZ8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abraxas1Q8BPZ8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abraxas1Q8BPZ8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abraxas1Q8BPZ8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abraxas1Q8BPZ8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abraxas1Q8BPZ8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abraxas1Q8BPZ8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abraxas1Q8BPZ8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abraxas1Q8BPZ8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abraxas1Q8BPZ8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abraxas1Q8BPZ8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abraxas1Q8BPZ8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Abraxas1Q8BPZ8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abraxas1Q8BPZ8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abraxas1Q8BPZ8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abraxas1Q8BPZ8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abraxas1Q8BPZ8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abraxas1Q8BPZ8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abraxas1Q8BPZ8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abraxas1Q8BPZ8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abraxas1Q8BPZ8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abraxas1Q8BPZ8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abraxas1Q8BPZ8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abraxas1Q8BPZ8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abraxas1Q8BPZ8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abraxas1Q8BPZ8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms