Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMJ8

Sp8, Transcription factor Sp8, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp8Q8BMJ8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sp8Q8BMJ8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sp8Q8BMJ8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sp8Q8BMJ8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sp8Q8BMJ8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sp8Q8BMJ8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sp8Q8BMJ8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Sp8Q8BMJ8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sp8Q8BMJ8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sp8Q8BMJ8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sp8Q8BMJ8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sp8Q8BMJ8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sp8Q8BMJ8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sp8Q8BMJ8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sp8Q8BMJ8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sp8Q8BMJ8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sp8Q8BMJ8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sp8Q8BMJ8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sp8Q8BMJ8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sp8Q8BMJ8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sp8Q8BMJ8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sp8Q8BMJ8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sp8Q8BMJ8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sp8Q8BMJ8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sp8Q8BMJ8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sp8Q8BMJ8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sp8Q8BMJ8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sp8Q8BMJ8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sp8Q8BMJ8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sp8Q8BMJ8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sp8Q8BMJ8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sp8Q8BMJ8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sp8Q8BMJ8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Sp8Q8BMJ8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sp8Q8BMJ8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sp8Q8BMJ8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sp8Q8BMJ8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Sp8Q8BMJ8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sp8Q8BMJ8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sp8Q8BMJ8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sp8Q8BMJ8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sp8Q8BMJ8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sp8Q8BMJ8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sp8Q8BMJ8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sp8Q8BMJ8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sp8Q8BMJ8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sp8Q8BMJ8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sp8Q8BMJ8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sp8Q8BMJ8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sp8Q8BMJ8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sp8Q8BMJ8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sp8Q8BMJ8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sp8Q8BMJ8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sp8Q8BMJ8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sp8Q8BMJ8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sp8Q8BMJ8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms