Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLF2

Cdkl3, Cyclin-dependent kinase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl3Q8BLF2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl3Q8BLF2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl3Q8BLF2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl3Q8BLF2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl3Q8BLF2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl3Q8BLF2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl3Q8BLF2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl3Q8BLF2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl3Q8BLF2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl3Q8BLF2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl3Q8BLF2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl3Q8BLF2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl3Q8BLF2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl3Q8BLF2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl3Q8BLF2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl3Q8BLF2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl3Q8BLF2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl3Q8BLF2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl3Q8BLF2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl3Q8BLF2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl3Q8BLF2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl3Q8BLF2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl3Q8BLF2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl3Q8BLF2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl3Q8BLF2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl3Q8BLF2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl3Q8BLF2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdkl3Q8BLF2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdkl3Q8BLF2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkl3Q8BLF2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkl3Q8BLF2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkl3Q8BLF2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkl3Q8BLF2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkl3Q8BLF2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl3Q8BLF2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl3Q8BLF2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl3Q8BLF2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl3Q8BLF2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl3Q8BLF2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl3Q8BLF2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl3Q8BLF2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl3Q8BLF2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl3Q8BLF2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl3Q8BLF2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl3Q8BLF2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkl3Q8BLF2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkl3Q8BLF2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkl3Q8BLF2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkl3Q8BLF2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms