Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zcchc4Q8BKW4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Zcchc4Q8BKW4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zcchc4Q8BKW4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms