Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rufy1Q8BIJ7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rufy1Q8BIJ7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rufy1Q8BIJ7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms