Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmco3Q8BH01 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmco3Q8BH01 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmco3Q8BH01 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms