Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Best2Q8BGM5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Best2Q8BGM5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Best2Q8BGM5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Best2Q8BGM5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Best2Q8BGM5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Best2Q8BGM5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Best2Q8BGM5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Best2Q8BGM5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Best2Q8BGM5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Best2Q8BGM5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Best2Q8BGM5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Best2Q8BGM5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Best2Q8BGM5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms