Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD7

Npas4, Neuronal PAS domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas4Q8BGD7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Npas4Q8BGD7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Npas4Q8BGD7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Npas4Q8BGD7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Npas4Q8BGD7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Npas4Q8BGD7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Npas4Q8BGD7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Npas4Q8BGD7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Npas4Q8BGD7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Npas4Q8BGD7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Npas4Q8BGD7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Npas4Q8BGD7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Npas4Q8BGD7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Npas4Q8BGD7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Npas4Q8BGD7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Npas4Q8BGD7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Npas4Q8BGD7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Npas4Q8BGD7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Npas4Q8BGD7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Npas4Q8BGD7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Npas4Q8BGD7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Npas4Q8BGD7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Npas4Q8BGD7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Npas4Q8BGD7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Npas4Q8BGD7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Npas4Q8BGD7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Npas4Q8BGD7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Npas4Q8BGD7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Npas4Q8BGD7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Npas4Q8BGD7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Npas4Q8BGD7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npas4Q8BGD7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npas4Q8BGD7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npas4Q8BGD7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npas4Q8BGD7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Npas4Q8BGD7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Npas4Q8BGD7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Npas4Q8BGD7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Npas4Q8BGD7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Npas4Q8BGD7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Npas4Q8BGD7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Npas4Q8BGD7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Npas4Q8BGD7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Npas4Q8BGD7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Npas4Q8BGD7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Npas4Q8BGD7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Npas4Q8BGD7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Npas4Q8BGD7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Npas4Q8BGD7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Npas4Q8BGD7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Npas4Q8BGD7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Npas4Q8BGD7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Npas4Q8BGD7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Npas4Q8BGD7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Npas4Q8BGD7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Npas4Q8BGD7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Npas4Q8BGD7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Npas4Q8BGD7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npas4Q8BGD7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npas4Q8BGD7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npas4Q8BGD7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npas4Q8BGD7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npas4Q8BGD7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npas4Q8BGD7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms