Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8BGC1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Q8BGC1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8BGC1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8BGC1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8BGC1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8BGC1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8BGC1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8BGC1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8BGC1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8BGC1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8BGC1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8BGC1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8BGC1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8BGC1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8BGC1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8BGC1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q8BGC1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q8BGC1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8BGC1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8BGC1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8BGC1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8BGC1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8BGC1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8BGC1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8BGC1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8BGC1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8BGC1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q8BGC1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q8BGC1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q8BGC1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q8BGC1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q8BGC1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q8BGC1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q8BGC1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q8BGC1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q8BGC1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q8BGC1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q8BGC1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q8BGC1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8BGC1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8BGC1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8BGC1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8BGC1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8BGC1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8BGC1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8BGC1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8BGC1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8BGC1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8BGC1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8BGC1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8BGC1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8BGC1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8BGC1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8BGC1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8BGC1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q8BGC1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q8BGC1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q8BGC1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q8BGC1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q8BGC1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q8BGC1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q8BGC1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q8BGC1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q8BGC1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q8BGC1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q8BGC1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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