Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Htatsf1Q8BGC0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Htatsf1Q8BGC0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Htatsf1Q8BGC0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Htatsf1Q8BGC0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Htatsf1Q8BGC0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Htatsf1Q8BGC0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Htatsf1Q8BGC0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Htatsf1Q8BGC0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Htatsf1Q8BGC0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Htatsf1Q8BGC0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Htatsf1Q8BGC0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Htatsf1Q8BGC0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Htatsf1Q8BGC0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Htatsf1Q8BGC0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Htatsf1Q8BGC0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
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