Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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