Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sv2bQ8BG39 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sv2bQ8BG39 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sv2bQ8BG39 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sv2bQ8BG39 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sv2bQ8BG39 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sv2bQ8BG39 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Sv2bQ8BG39 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sv2bQ8BG39 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sv2bQ8BG39 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sv2bQ8BG39 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Sv2bQ8BG39 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sv2bQ8BG39 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sv2bQ8BG39 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sv2bQ8BG39 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Sv2bQ8BG39 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sv2bQ8BG39 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sv2bQ8BG39 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sv2bQ8BG39 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sv2bQ8BG39 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sv2bQ8BG39 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sv2bQ8BG39 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sv2bQ8BG39 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sv2bQ8BG39 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sv2bQ8BG39 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sv2bQ8BG39 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Sv2bQ8BG39 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sv2bQ8BG39 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sv2bQ8BG39 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sv2bQ8BG39 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sv2bQ8BG39 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sv2bQ8BG39 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sv2bQ8BG39 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sv2bQ8BG39 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sv2bQ8BG39 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sv2bQ8BG39 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sv2bQ8BG39 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sv2bQ8BG39 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sv2bQ8BG39 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sv2bQ8BG39 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sv2bQ8BG39 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sv2bQ8BG39 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Sv2bQ8BG39 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sv2bQ8BG39 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sv2bQ8BG39 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sv2bQ8BG39 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sv2bQ8BG39 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sv2bQ8BG39 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sv2bQ8BG39 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sv2bQ8BG39 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sv2bQ8BG39 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sv2bQ8BG39 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sv2bQ8BG39 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sv2bQ8BG39 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sv2bQ8BG39 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sv2bQ8BG39 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sv2bQ8BG39 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sv2bQ8BG39 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sv2bQ8BG39 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sv2bQ8BG39 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sv2bQ8BG39 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sv2bQ8BG39 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sv2bQ8BG39 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sv2bQ8BG39 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sv2bQ8BG39 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 392.3 ms