Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFU8

Slc17a8, Vesicular glutamate transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a8Q8BFU8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc17a8Q8BFU8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc17a8Q8BFU8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc17a8Q8BFU8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc17a8Q8BFU8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc17a8Q8BFU8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc17a8Q8BFU8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc17a8Q8BFU8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc17a8Q8BFU8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc17a8Q8BFU8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc17a8Q8BFU8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc17a8Q8BFU8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc17a8Q8BFU8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc17a8Q8BFU8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc17a8Q8BFU8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc17a8Q8BFU8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc17a8Q8BFU8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc17a8Q8BFU8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc17a8Q8BFU8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc17a8Q8BFU8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc17a8Q8BFU8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc17a8Q8BFU8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc17a8Q8BFU8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc17a8Q8BFU8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc17a8Q8BFU8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc17a8Q8BFU8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc17a8Q8BFU8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc17a8Q8BFU8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc17a8Q8BFU8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc17a8Q8BFU8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc17a8Q8BFU8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc17a8Q8BFU8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc17a8Q8BFU8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slc17a8Q8BFU8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc17a8Q8BFU8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc17a8Q8BFU8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc17a8Q8BFU8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc17a8Q8BFU8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc17a8Q8BFU8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc17a8Q8BFU8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc17a8Q8BFU8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc17a8Q8BFU8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc17a8Q8BFU8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc17a8Q8BFU8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc17a8Q8BFU8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc17a8Q8BFU8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc17a8Q8BFU8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc17a8Q8BFU8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc17a8Q8BFU8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc17a8Q8BFU8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc17a8Q8BFU8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc17a8Q8BFU8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc17a8Q8BFU8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc17a8Q8BFU8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc17a8Q8BFU8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc17a8Q8BFU8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc17a8Q8BFU8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc17a8Q8BFU8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc17a8Q8BFU8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc17a8Q8BFU8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc17a8Q8BFU8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms