Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zbed4Q80WQ9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Zbed4Q80WQ9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbed4Q80WQ9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbed4Q80WQ9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbed4Q80WQ9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zbed4Q80WQ9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zbed4Q80WQ9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zbed4Q80WQ9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Zbed4Q80WQ9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zbed4Q80WQ9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbed4Q80WQ9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbed4Q80WQ9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbed4Q80WQ9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbed4Q80WQ9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbed4Q80WQ9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zbed4Q80WQ9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zbed4Q80WQ9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zbed4Q80WQ9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zbed4Q80WQ9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zbed4Q80WQ9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zbed4Q80WQ9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbed4Q80WQ9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbed4Q80WQ9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbed4Q80WQ9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbed4Q80WQ9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbed4Q80WQ9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbed4Q80WQ9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbed4Q80WQ9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zbed4Q80WQ9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Zbed4Q80WQ9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms