Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sestd1Q80UK0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sestd1Q80UK0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sestd1Q80UK0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sestd1Q80UK0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sestd1Q80UK0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sestd1Q80UK0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sestd1Q80UK0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sestd1Q80UK0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sestd1Q80UK0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sestd1Q80UK0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sestd1Q80UK0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sestd1Q80UK0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sestd1Q80UK0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sestd1Q80UK0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sestd1Q80UK0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sestd1Q80UK0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sestd1Q80UK0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sestd1Q80UK0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sestd1Q80UK0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sestd1Q80UK0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sestd1Q80UK0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sestd1Q80UK0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sestd1Q80UK0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sestd1Q80UK0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sestd1Q80UK0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sestd1Q80UK0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sestd1Q80UK0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sestd1Q80UK0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sestd1Q80UK0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sestd1Q80UK0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sestd1Q80UK0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sestd1Q80UK0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sestd1Q80UK0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sestd1Q80UK0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms