Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atf7ipQ7TT18 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atf7ipQ7TT18 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atf7ipQ7TT18 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atf7ipQ7TT18 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atf7ipQ7TT18 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atf7ipQ7TT18 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atf7ipQ7TT18 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atf7ipQ7TT18 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atf7ipQ7TT18 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atf7ipQ7TT18 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atf7ipQ7TT18 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atf7ipQ7TT18 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atf7ipQ7TT18 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atf7ipQ7TT18 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atf7ipQ7TT18 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atf7ipQ7TT18 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atf7ipQ7TT18 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atf7ipQ7TT18 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atf7ipQ7TT18 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atf7ipQ7TT18 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Atf7ipQ7TT18 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atf7ipQ7TT18 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atf7ipQ7TT18 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atf7ipQ7TT18 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atf7ipQ7TT18 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Atf7ipQ7TT18 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Atf7ipQ7TT18 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atf7ipQ7TT18 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atf7ipQ7TT18 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atf7ipQ7TT18 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atf7ipQ7TT18 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atf7ipQ7TT18 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atf7ipQ7TT18 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Atf7ipQ7TT18 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atf7ipQ7TT18 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atf7ipQ7TT18 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atf7ipQ7TT18 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atf7ipQ7TT18 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atf7ipQ7TT18 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atf7ipQ7TT18 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atf7ipQ7TT18 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atf7ipQ7TT18 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atf7ipQ7TT18 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atf7ipQ7TT18 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atf7ipQ7TT18 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atf7ipQ7TT18 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atf7ipQ7TT18 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Atf7ipQ7TT18 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atf7ipQ7TT18 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atf7ipQ7TT18 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Atf7ipQ7TT18 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atf7ipQ7TT18 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atf7ipQ7TT18 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atf7ipQ7TT18 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atf7ipQ7TT18 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atf7ipQ7TT18 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Atf7ipQ7TT18 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Atf7ipQ7TT18 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atf7ipQ7TT18 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms