Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClmQ7TSN2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ClmQ7TSN2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClmQ7TSN2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms