Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nphp3Q7TNH6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nphp3Q7TNH6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nphp3Q7TNH6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nphp3Q7TNH6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nphp3Q7TNH6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nphp3Q7TNH6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nphp3Q7TNH6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nphp3Q7TNH6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nphp3Q7TNH6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nphp3Q7TNH6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nphp3Q7TNH6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nphp3Q7TNH6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nphp3Q7TNH6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nphp3Q7TNH6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nphp3Q7TNH6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nphp3Q7TNH6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nphp3Q7TNH6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nphp3Q7TNH6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nphp3Q7TNH6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nphp3Q7TNH6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nphp3Q7TNH6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nphp3Q7TNH6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nphp3Q7TNH6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nphp3Q7TNH6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Nphp3Q7TNH6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nphp3Q7TNH6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nphp3Q7TNH6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Nphp3Q7TNH6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nphp3Q7TNH6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Nphp3Q7TNH6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nphp3Q7TNH6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nphp3Q7TNH6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nphp3Q7TNH6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Nphp3Q7TNH6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nphp3Q7TNH6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nphp3Q7TNH6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nphp3Q7TNH6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Nphp3Q7TNH6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Nphp3Q7TNH6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nphp3Q7TNH6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nphp3Q7TNH6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nphp3Q7TNH6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nphp3Q7TNH6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nphp3Q7TNH6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nphp3Q7TNH6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nphp3Q7TNH6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nphp3Q7TNH6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nphp3Q7TNH6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nphp3Q7TNH6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nphp3Q7TNH6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Nphp3Q7TNH6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nphp3Q7TNH6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nphp3Q7TNH6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nphp3Q7TNH6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nphp3Q7TNH6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nphp3Q7TNH6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nphp3Q7TNH6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms