Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ7

Spcs3, Signal peptidase complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spcs3Q6ZWQ7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spcs3Q6ZWQ7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spcs3Q6ZWQ7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms