Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ncapd3Q6ZQK0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ncapd3Q6ZQK0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ncapd3Q6ZQK0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ncapd3Q6ZQK0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ncapd3Q6ZQK0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ncapd3Q6ZQK0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ncapd3Q6ZQK0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ncapd3Q6ZQK0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ncapd3Q6ZQK0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ncapd3Q6ZQK0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Ncapd3Q6ZQK0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ncapd3Q6ZQK0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Ncapd3Q6ZQK0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ncapd3Q6ZQK0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Ncapd3Q6ZQK0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ncapd3Q6ZQK0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ncapd3Q6ZQK0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ncapd3Q6ZQK0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ncapd3Q6ZQK0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ncapd3Q6ZQK0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ncapd3Q6ZQK0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ncapd3Q6ZQK0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ncapd3Q6ZQK0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ncapd3Q6ZQK0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ncapd3Q6ZQK0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ncapd3Q6ZQK0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ncapd3Q6ZQK0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ncapd3Q6ZQK0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ncapd3Q6ZQK0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ncapd3Q6ZQK0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ncapd3Q6ZQK0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ncapd3Q6ZQK0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Ncapd3Q6ZQK0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Ncapd3Q6ZQK0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Ncapd3Q6ZQK0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Ncapd3Q6ZQK0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ncapd3Q6ZQK0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ncapd3Q6ZQK0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ncapd3Q6ZQK0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ncapd3Q6ZQK0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ncapd3Q6ZQK0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ncapd3Q6ZQK0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Ncapd3Q6ZQK0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ncapd3Q6ZQK0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Ncapd3Q6ZQK0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ncapd3Q6ZQK0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ncapd3Q6ZQK0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ncapd3Q6ZQK0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ncapd3Q6ZQK0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ncapd3Q6ZQK0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ncapd3Q6ZQK0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ncapd3Q6ZQK0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ncapd3Q6ZQK0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ncapd3Q6ZQK0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ncapd3Q6ZQK0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Ncapd3Q6ZQK0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ncapd3Q6ZQK0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Ncapd3Q6ZQK0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ncapd3Q6ZQK0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ncapd3Q6ZQK0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ncapd3Q6ZQK0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ncapd3Q6ZQK0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Ncapd3Q6ZQK0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
Ncapd3Q6ZQK0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ncapd3Q6ZQK0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ncapd3Q6ZQK0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ncapd3Q6ZQK0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ncapd3Q6ZQK0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ncapd3Q6ZQK0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ncapd3Q6ZQK0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ncapd3Q6ZQK0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ncapd3Q6ZQK0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ncapd3Q6ZQK0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ncapd3Q6ZQK0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ncapd3Q6ZQK0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Ncapd3Q6ZQK0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ncapd3Q6ZQK0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ncapd3Q6ZQK0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ncapd3Q6ZQK0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ncapd3Q6ZQK0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ncapd3Q6ZQK0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms