Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nup188Q6ZQH8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nup188Q6ZQH8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nup188Q6ZQH8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nup188Q6ZQH8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup188Q6ZQH8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup188Q6ZQH8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup188Q6ZQH8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup188Q6ZQH8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup188Q6ZQH8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup188Q6ZQH8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup188Q6ZQH8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup188Q6ZQH8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup188Q6ZQH8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup188Q6ZQH8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup188Q6ZQH8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nup188Q6ZQH8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nup188Q6ZQH8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nup188Q6ZQH8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nup188Q6ZQH8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nup188Q6ZQH8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nup188Q6ZQH8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nup188Q6ZQH8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nup188Q6ZQH8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Nup188Q6ZQH8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Nup188Q6ZQH8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nup188Q6ZQH8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nup188Q6ZQH8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nup188Q6ZQH8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Nup188Q6ZQH8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nup188Q6ZQH8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nup188Q6ZQH8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nup188Q6ZQH8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nup188Q6ZQH8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nup188Q6ZQH8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nup188Q6ZQH8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nup188Q6ZQH8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nup188Q6ZQH8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nup188Q6ZQH8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Nup188Q6ZQH8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nup188Q6ZQH8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nup188Q6ZQH8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nup188Q6ZQH8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nup188Q6ZQH8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nup188Q6ZQH8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nup188Q6ZQH8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nup188Q6ZQH8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nup188Q6ZQH8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nup188Q6ZQH8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nup188Q6ZQH8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nup188Q6ZQH8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nup188Q6ZQH8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nup188Q6ZQH8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nup188Q6ZQH8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nup188Q6ZQH8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nup188Q6ZQH8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nup188Q6ZQH8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nup188Q6ZQH8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nup188Q6ZQH8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nup188Q6ZQH8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nup188Q6ZQH8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nup188Q6ZQH8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nup188Q6ZQH8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nup188Q6ZQH8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nup188Q6ZQH8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nup188Q6ZQH8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nup188Q6ZQH8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nup188Q6ZQH8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nup188Q6ZQH8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nup188Q6ZQH8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nup188Q6ZQH8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nup188Q6ZQH8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nup188Q6ZQH8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nup188Q6ZQH8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nup188Q6ZQH8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nup188Q6ZQH8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nup188Q6ZQH8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Nup188Q6ZQH8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nup188Q6ZQH8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nup188Q6ZQH8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nup188Q6ZQH8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nup188Q6ZQH8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nup188Q6ZQH8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nup188Q6ZQH8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nup188Q6ZQH8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nup188Q6ZQH8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nup188Q6ZQH8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nup188Q6ZQH8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nup188Q6ZQH8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nup188Q6ZQH8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Nup188Q6ZQH8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup188Q6ZQH8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup188Q6ZQH8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup188Q6ZQH8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup188Q6ZQH8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup188Q6ZQH8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nup188Q6ZQH8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nup188Q6ZQH8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nup188Q6ZQH8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nup188Q6ZQH8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120 ms