Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Topbp1Q6ZQF0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Topbp1Q6ZQF0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Topbp1Q6ZQF0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Topbp1Q6ZQF0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Topbp1Q6ZQF0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Topbp1Q6ZQF0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Topbp1Q6ZQF0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Topbp1Q6ZQF0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Topbp1Q6ZQF0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Topbp1Q6ZQF0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Topbp1Q6ZQF0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Topbp1Q6ZQF0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Topbp1Q6ZQF0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Topbp1Q6ZQF0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Topbp1Q6ZQF0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Topbp1Q6ZQF0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Topbp1Q6ZQF0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Topbp1Q6ZQF0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Topbp1Q6ZQF0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Topbp1Q6ZQF0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Topbp1Q6ZQF0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Topbp1Q6ZQF0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Topbp1Q6ZQF0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Topbp1Q6ZQF0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Topbp1Q6ZQF0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Topbp1Q6ZQF0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Topbp1Q6ZQF0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Topbp1Q6ZQF0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Topbp1Q6ZQF0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Topbp1Q6ZQF0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Topbp1Q6ZQF0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Topbp1Q6ZQF0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Topbp1Q6ZQF0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Topbp1Q6ZQF0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Topbp1Q6ZQF0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Topbp1Q6ZQF0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Topbp1Q6ZQF0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Topbp1Q6ZQF0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Topbp1Q6ZQF0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Topbp1Q6ZQF0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Topbp1Q6ZQF0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Topbp1Q6ZQF0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Topbp1Q6ZQF0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Topbp1Q6ZQF0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Topbp1Q6ZQF0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Topbp1Q6ZQF0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Topbp1Q6ZQF0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Topbp1Q6ZQF0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Topbp1Q6ZQF0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Topbp1Q6ZQF0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms