Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nemp1Q6ZQE4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nemp1Q6ZQE4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nemp1Q6ZQE4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms