Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ0

Cd300a, CMRF35-like molecule 8, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300aQ6SJQ0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd300aQ6SJQ0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd300aQ6SJQ0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd300aQ6SJQ0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd300aQ6SJQ0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd300aQ6SJQ0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd300aQ6SJQ0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd300aQ6SJQ0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd300aQ6SJQ0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd300aQ6SJQ0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd300aQ6SJQ0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd300aQ6SJQ0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cd300aQ6SJQ0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd300aQ6SJQ0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms