Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Krt9Q6RHW0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt9Q6RHW0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt9Q6RHW0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt9Q6RHW0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt9Q6RHW0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt9Q6RHW0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt9Q6RHW0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt9Q6RHW0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt9Q6RHW0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt9Q6RHW0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt9Q6RHW0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt9Q6RHW0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt9Q6RHW0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt9Q6RHW0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt9Q6RHW0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt9Q6RHW0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt9Q6RHW0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt9Q6RHW0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt9Q6RHW0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt9Q6RHW0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt9Q6RHW0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt9Q6RHW0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt9Q6RHW0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt9Q6RHW0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt9Q6RHW0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt9Q6RHW0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt9Q6RHW0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt9Q6RHW0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms