Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GcsamQ6RFH4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GcsamQ6RFH4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GcsamQ6RFH4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GcsamQ6RFH4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GcsamQ6RFH4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GcsamQ6RFH4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GcsamQ6RFH4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GcsamQ6RFH4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GcsamQ6RFH4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GcsamQ6RFH4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GcsamQ6RFH4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GcsamQ6RFH4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GcsamQ6RFH4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GcsamQ6RFH4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GcsamQ6RFH4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GcsamQ6RFH4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GcsamQ6RFH4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GcsamQ6RFH4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GcsamQ6RFH4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GcsamQ6RFH4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GcsamQ6RFH4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GcsamQ6RFH4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GcsamQ6RFH4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GcsamQ6RFH4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GcsamQ6RFH4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GcsamQ6RFH4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GcsamQ6RFH4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GcsamQ6RFH4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GcsamQ6RFH4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GcsamQ6RFH4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GcsamQ6RFH4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GcsamQ6RFH4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
GcsamQ6RFH4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GcsamQ6RFH4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GcsamQ6RFH4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GcsamQ6RFH4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms