Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atp2b4Q6Q477 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atp2b4Q6Q477 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atp2b4Q6Q477 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Atp2b4Q6Q477 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atp2b4Q6Q477 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atp2b4Q6Q477 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atp2b4Q6Q477 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp2b4Q6Q477 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp2b4Q6Q477 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp2b4Q6Q477 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms