Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NfrkbQ6PIJ4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NfrkbQ6PIJ4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NfrkbQ6PIJ4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms