Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Kcnip4Q6PHZ8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnip4Q6PHZ8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kcnip4Q6PHZ8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms