Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS9

Cacna2d2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d2Q6PHS9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cacna2d2Q6PHS9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacna2d2Q6PHS9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacna2d2Q6PHS9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms