Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nup98Q6PFD9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nup98Q6PFD9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nup98Q6PFD9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Nup98Q6PFD9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nup98Q6PFD9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nup98Q6PFD9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nup98Q6PFD9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup98Q6PFD9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup98Q6PFD9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup98Q6PFD9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup98Q6PFD9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup98Q6PFD9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup98Q6PFD9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup98Q6PFD9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup98Q6PFD9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup98Q6PFD9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup98Q6PFD9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup98Q6PFD9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup98Q6PFD9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup98Q6PFD9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup98Q6PFD9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup98Q6PFD9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup98Q6PFD9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup98Q6PFD9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup98Q6PFD9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nup98Q6PFD9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nup98Q6PFD9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nup98Q6PFD9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup98Q6PFD9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup98Q6PFD9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup98Q6PFD9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup98Q6PFD9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup98Q6PFD9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup98Q6PFD9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup98Q6PFD9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup98Q6PFD9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup98Q6PFD9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup98Q6PFD9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup98Q6PFD9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nup98Q6PFD9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup98Q6PFD9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup98Q6PFD9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup98Q6PFD9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup98Q6PFD9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup98Q6PFD9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup98Q6PFD9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup98Q6PFD9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup98Q6PFD9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup98Q6PFD9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup98Q6PFD9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup98Q6PFD9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup98Q6PFD9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nup98Q6PFD9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nup98Q6PFD9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nup98Q6PFD9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nup98Q6PFD9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nup98Q6PFD9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nup98Q6PFD9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nup98Q6PFD9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nup98Q6PFD9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nup98Q6PFD9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nup98Q6PFD9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms