Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Mfsd4aQ6PDC8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mfsd4aQ6PDC8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mfsd4aQ6PDC8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mfsd4aQ6PDC8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mfsd4aQ6PDC8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mfsd4aQ6PDC8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mfsd4aQ6PDC8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfsd4aQ6PDC8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mfsd4aQ6PDC8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms