Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Gapvd1Q6PAR5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Gapvd1Q6PAR5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Gapvd1Q6PAR5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Gapvd1Q6PAR5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Gapvd1Q6PAR5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Gapvd1Q6PAR5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Gapvd1Q6PAR5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Gapvd1Q6PAR5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Gapvd1Q6PAR5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Gapvd1Q6PAR5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Gapvd1Q6PAR5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Gapvd1Q6PAR5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Gapvd1Q6PAR5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Gapvd1Q6PAR5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Gapvd1Q6PAR5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Gapvd1Q6PAR5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Gapvd1Q6PAR5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Gapvd1Q6PAR5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Gapvd1Q6PAR5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Gapvd1Q6PAR5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Gapvd1Q6PAR5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Gapvd1Q6PAR5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Gapvd1Q6PAR5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Gapvd1Q6PAR5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Gapvd1Q6PAR5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Gapvd1Q6PAR5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Gapvd1Q6PAR5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Gapvd1Q6PAR5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Gapvd1Q6PAR5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Gapvd1Q6PAR5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Gapvd1Q6PAR5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Gapvd1Q6PAR5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Gapvd1Q6PAR5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Gapvd1Q6PAR5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Gapvd1Q6PAR5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Gapvd1Q6PAR5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Gapvd1Q6PAR5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Gapvd1Q6PAR5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Gapvd1Q6PAR5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Gapvd1Q6PAR5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Gapvd1Q6PAR5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Gapvd1Q6PAR5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Gapvd1Q6PAR5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Gapvd1Q6PAR5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Gapvd1Q6PAR5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Gapvd1Q6PAR5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Gapvd1Q6PAR5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Gapvd1Q6PAR5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Gapvd1Q6PAR5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Gapvd1Q6PAR5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Gapvd1Q6PAR5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Gapvd1Q6PAR5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Gapvd1Q6PAR5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Gapvd1Q6PAR5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Gapvd1Q6PAR5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Gapvd1Q6PAR5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Gapvd1Q6PAR5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Gapvd1Q6PAR5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Gapvd1Q6PAR5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Gapvd1Q6PAR5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Gapvd1Q6PAR5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Gapvd1Q6PAR5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Gapvd1Q6PAR5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Gapvd1Q6PAR5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Gapvd1Q6PAR5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Gapvd1Q6PAR5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Gapvd1Q6PAR5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Gapvd1Q6PAR5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Gapvd1Q6PAR5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Gapvd1Q6PAR5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Gapvd1Q6PAR5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Gapvd1Q6PAR5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Gapvd1Q6PAR5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Gapvd1Q6PAR5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Gapvd1Q6PAR5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Gapvd1Q6PAR5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Gapvd1Q6PAR5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Gapvd1Q6PAR5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Gapvd1Q6PAR5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Gapvd1Q6PAR5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Gapvd1Q6PAR5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Gapvd1Q6PAR5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Gapvd1Q6PAR5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Gapvd1Q6PAR5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Gapvd1Q6PAR5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Gapvd1Q6PAR5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Gapvd1Q6PAR5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Gapvd1Q6PAR5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Gapvd1Q6PAR5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Gapvd1Q6PAR5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Gapvd1Q6PAR5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Gapvd1Q6PAR5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Gapvd1Q6PAR5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Gapvd1Q6PAR5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Gapvd1Q6PAR5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Gapvd1Q6PAR5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Gapvd1Q6PAR5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Gapvd1Q6PAR5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Gapvd1Q6PAR5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms