Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W5

Tsen2, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen2, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsen2Q6P7W5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tsen2Q6P7W5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tsen2Q6P7W5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Tsen2Q6P7W5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tsen2Q6P7W5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Tsen2Q6P7W5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tsen2Q6P7W5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tsen2Q6P7W5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tsen2Q6P7W5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tsen2Q6P7W5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Tsen2Q6P7W5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tsen2Q6P7W5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tsen2Q6P7W5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Tsen2Q6P7W5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Tsen2Q6P7W5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Tsen2Q6P7W5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tsen2Q6P7W5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tsen2Q6P7W5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tsen2Q6P7W5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tsen2Q6P7W5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tsen2Q6P7W5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tsen2Q6P7W5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tsen2Q6P7W5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tsen2Q6P7W5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tsen2Q6P7W5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tsen2Q6P7W5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tsen2Q6P7W5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tsen2Q6P7W5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tsen2Q6P7W5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tsen2Q6P7W5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tsen2Q6P7W5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tsen2Q6P7W5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tsen2Q6P7W5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tsen2Q6P7W5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tsen2Q6P7W5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Tsen2Q6P7W5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tsen2Q6P7W5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tsen2Q6P7W5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tsen2Q6P7W5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tsen2Q6P7W5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Tsen2Q6P7W5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tsen2Q6P7W5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tsen2Q6P7W5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tsen2Q6P7W5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tsen2Q6P7W5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tsen2Q6P7W5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tsen2Q6P7W5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tsen2Q6P7W5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tsen2Q6P7W5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tsen2Q6P7W5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tsen2Q6P7W5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tsen2Q6P7W5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tsen2Q6P7W5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tsen2Q6P7W5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tsen2Q6P7W5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Tsen2Q6P7W5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tsen2Q6P7W5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tsen2Q6P7W5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tsen2Q6P7W5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tsen2Q6P7W5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tsen2Q6P7W5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tsen2Q6P7W5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tsen2Q6P7W5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms