Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6J4

Alkbh2, DNA oxidative demethylase ALKBH2, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh2Q6P6J4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Alkbh2Q6P6J4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh2Q6P6J4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms