Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4U0

Thsd7b, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7bQ6P4U0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Thsd7bQ6P4U0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Thsd7bQ6P4U0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Thsd7bQ6P4U0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Thsd7bQ6P4U0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Thsd7bQ6P4U0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Thsd7bQ6P4U0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Thsd7bQ6P4U0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Thsd7bQ6P4U0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Thsd7bQ6P4U0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Thsd7bQ6P4U0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Thsd7bQ6P4U0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Thsd7bQ6P4U0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Thsd7bQ6P4U0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Thsd7bQ6P4U0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Thsd7bQ6P4U0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Thsd7bQ6P4U0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Thsd7bQ6P4U0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Thsd7bQ6P4U0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Thsd7bQ6P4U0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Thsd7bQ6P4U0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Thsd7bQ6P4U0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Thsd7bQ6P4U0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Thsd7bQ6P4U0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Thsd7bQ6P4U0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Thsd7bQ6P4U0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Thsd7bQ6P4U0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Thsd7bQ6P4U0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Thsd7bQ6P4U0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Thsd7bQ6P4U0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Thsd7bQ6P4U0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Thsd7bQ6P4U0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Thsd7bQ6P4U0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Thsd7bQ6P4U0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Thsd7bQ6P4U0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Thsd7bQ6P4U0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Thsd7bQ6P4U0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Thsd7bQ6P4U0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Thsd7bQ6P4U0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Thsd7bQ6P4U0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Thsd7bQ6P4U0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Thsd7bQ6P4U0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Thsd7bQ6P4U0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Thsd7bQ6P4U0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Thsd7bQ6P4U0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Thsd7bQ6P4U0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Thsd7bQ6P4U0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Thsd7bQ6P4U0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Thsd7bQ6P4U0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Thsd7bQ6P4U0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Thsd7bQ6P4U0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Thsd7bQ6P4U0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Thsd7bQ6P4U0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Thsd7bQ6P4U0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Thsd7bQ6P4U0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Thsd7bQ6P4U0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Thsd7bQ6P4U0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Thsd7bQ6P4U0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Thsd7bQ6P4U0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Thsd7bQ6P4U0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Thsd7bQ6P4U0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Thsd7bQ6P4U0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Thsd7bQ6P4U0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Thsd7bQ6P4U0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Thsd7bQ6P4U0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Thsd7bQ6P4U0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Thsd7bQ6P4U0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Thsd7bQ6P4U0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Thsd7bQ6P4U0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Thsd7bQ6P4U0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Thsd7bQ6P4U0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Thsd7bQ6P4U0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Thsd7bQ6P4U0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Thsd7bQ6P4U0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Thsd7bQ6P4U0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Thsd7bQ6P4U0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Thsd7bQ6P4U0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Thsd7bQ6P4U0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Thsd7bQ6P4U0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Thsd7bQ6P4U0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Thsd7bQ6P4U0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Thsd7bQ6P4U0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Thsd7bQ6P4U0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Thsd7bQ6P4U0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Thsd7bQ6P4U0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Thsd7bQ6P4U0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Thsd7bQ6P4U0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Thsd7bQ6P4U0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Thsd7bQ6P4U0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Thsd7bQ6P4U0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Thsd7bQ6P4U0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Thsd7bQ6P4U0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Thsd7bQ6P4U0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Thsd7bQ6P4U0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Thsd7bQ6P4U0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Thsd7bQ6P4U0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Thsd7bQ6P4U0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Thsd7bQ6P4U0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Thsd7bQ6P4U0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Thsd7bQ6P4U0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms