Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PrimpolQ6P1E7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PrimpolQ6P1E7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PrimpolQ6P1E7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PrimpolQ6P1E7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PrimpolQ6P1E7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PrimpolQ6P1E7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PrimpolQ6P1E7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PrimpolQ6P1E7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PrimpolQ6P1E7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PrimpolQ6P1E7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PrimpolQ6P1E7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PrimpolQ6P1E7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PrimpolQ6P1E7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PrimpolQ6P1E7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PrimpolQ6P1E7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PrimpolQ6P1E7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PrimpolQ6P1E7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PrimpolQ6P1E7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PrimpolQ6P1E7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PrimpolQ6P1E7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PrimpolQ6P1E7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PrimpolQ6P1E7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PrimpolQ6P1E7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PrimpolQ6P1E7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PrimpolQ6P1E7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PrimpolQ6P1E7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PrimpolQ6P1E7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PrimpolQ6P1E7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PrimpolQ6P1E7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PrimpolQ6P1E7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PrimpolQ6P1E7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PrimpolQ6P1E7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PrimpolQ6P1E7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PrimpolQ6P1E7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PrimpolQ6P1E7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PrimpolQ6P1E7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PrimpolQ6P1E7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PrimpolQ6P1E7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PrimpolQ6P1E7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PrimpolQ6P1E7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PrimpolQ6P1E7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PrimpolQ6P1E7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PrimpolQ6P1E7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PrimpolQ6P1E7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PrimpolQ6P1E7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PrimpolQ6P1E7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PrimpolQ6P1E7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PrimpolQ6P1E7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PrimpolQ6P1E7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PrimpolQ6P1E7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PrimpolQ6P1E7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PrimpolQ6P1E7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PrimpolQ6P1E7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PrimpolQ6P1E7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PrimpolQ6P1E7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PrimpolQ6P1E7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PrimpolQ6P1E7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PrimpolQ6P1E7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PrimpolQ6P1E7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PrimpolQ6P1E7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PrimpolQ6P1E7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PrimpolQ6P1E7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PrimpolQ6P1E7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PrimpolQ6P1E7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PrimpolQ6P1E7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PrimpolQ6P1E7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PrimpolQ6P1E7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PrimpolQ6P1E7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PrimpolQ6P1E7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PrimpolQ6P1E7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PrimpolQ6P1E7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PrimpolQ6P1E7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PrimpolQ6P1E7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PrimpolQ6P1E7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PrimpolQ6P1E7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PrimpolQ6P1E7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PrimpolQ6P1E7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PrimpolQ6P1E7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PrimpolQ6P1E7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PrimpolQ6P1E7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrimpolQ6P1E7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrimpolQ6P1E7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrimpolQ6P1E7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrimpolQ6P1E7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrimpolQ6P1E7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrimpolQ6P1E7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrimpolQ6P1E7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PrimpolQ6P1E7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PrimpolQ6P1E7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PrimpolQ6P1E7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PrimpolQ6P1E7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PrimpolQ6P1E7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PrimpolQ6P1E7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PrimpolQ6P1E7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PrimpolQ6P1E7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PrimpolQ6P1E7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms