Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms