Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SphkapQ6NSW3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SphkapQ6NSW3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SphkapQ6NSW3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SphkapQ6NSW3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SphkapQ6NSW3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SphkapQ6NSW3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SphkapQ6NSW3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SphkapQ6NSW3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SphkapQ6NSW3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SphkapQ6NSW3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SphkapQ6NSW3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SphkapQ6NSW3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SphkapQ6NSW3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SphkapQ6NSW3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
SphkapQ6NSW3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SphkapQ6NSW3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SphkapQ6NSW3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
SphkapQ6NSW3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SphkapQ6NSW3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SphkapQ6NSW3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SphkapQ6NSW3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SphkapQ6NSW3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SphkapQ6NSW3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SphkapQ6NSW3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
SphkapQ6NSW3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SphkapQ6NSW3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SphkapQ6NSW3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SphkapQ6NSW3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SphkapQ6NSW3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SphkapQ6NSW3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SphkapQ6NSW3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SphkapQ6NSW3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SphkapQ6NSW3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SphkapQ6NSW3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SphkapQ6NSW3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SphkapQ6NSW3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SphkapQ6NSW3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
SphkapQ6NSW3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SphkapQ6NSW3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SphkapQ6NSW3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SphkapQ6NSW3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SphkapQ6NSW3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
SphkapQ6NSW3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SphkapQ6NSW3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SphkapQ6NSW3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SphkapQ6NSW3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SphkapQ6NSW3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SphkapQ6NSW3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SphkapQ6NSW3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SphkapQ6NSW3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SphkapQ6NSW3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SphkapQ6NSW3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SphkapQ6NSW3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SphkapQ6NSW3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC31.64■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
SphkapQ6NSW3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SphkapQ6NSW3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SphkapQ6NSW3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SphkapQ6NSW3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms