Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Edrf1Q6GQV7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Edrf1Q6GQV7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Edrf1Q6GQV7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Edrf1Q6GQV7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Edrf1Q6GQV7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Edrf1Q6GQV7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Edrf1Q6GQV7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Edrf1Q6GQV7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Edrf1Q6GQV7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Edrf1Q6GQV7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Edrf1Q6GQV7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Edrf1Q6GQV7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Edrf1Q6GQV7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Edrf1Q6GQV7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Edrf1Q6GQV7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Edrf1Q6GQV7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Edrf1Q6GQV7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Edrf1Q6GQV7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Edrf1Q6GQV7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Edrf1Q6GQV7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Edrf1Q6GQV7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Edrf1Q6GQV7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Edrf1Q6GQV7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Edrf1Q6GQV7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Edrf1Q6GQV7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Edrf1Q6GQV7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Edrf1Q6GQV7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Edrf1Q6GQV7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Edrf1Q6GQV7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Edrf1Q6GQV7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Edrf1Q6GQV7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Edrf1Q6GQV7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Edrf1Q6GQV7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Edrf1Q6GQV7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Edrf1Q6GQV7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Edrf1Q6GQV7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Edrf1Q6GQV7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Edrf1Q6GQV7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Edrf1Q6GQV7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Edrf1Q6GQV7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Edrf1Q6GQV7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms