Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbf1Q6DFZ1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gbf1Q6DFZ1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gbf1Q6DFZ1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbf1Q6DFZ1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbf1Q6DFZ1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbf1Q6DFZ1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gbf1Q6DFZ1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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