Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp11bQ6DFW5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp11bQ6DFW5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp11bQ6DFW5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp11bQ6DFW5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp11bQ6DFW5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp11bQ6DFW5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp11bQ6DFW5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp11bQ6DFW5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp11bQ6DFW5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp11bQ6DFW5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp11bQ6DFW5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp11bQ6DFW5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp11bQ6DFW5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp11bQ6DFW5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp11bQ6DFW5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp11bQ6DFW5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp11bQ6DFW5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp11bQ6DFW5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp11bQ6DFW5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp11bQ6DFW5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp11bQ6DFW5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp11bQ6DFW5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp11bQ6DFW5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp11bQ6DFW5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp11bQ6DFW5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp11bQ6DFW5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp11bQ6DFW5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp11bQ6DFW5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp11bQ6DFW5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atp11bQ6DFW5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp11bQ6DFW5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11bQ6DFW5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms