Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nop58Q6DFW4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nop58Q6DFW4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nop58Q6DFW4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nop58Q6DFW4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nop58Q6DFW4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nop58Q6DFW4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nop58Q6DFW4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nop58Q6DFW4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nop58Q6DFW4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nop58Q6DFW4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nop58Q6DFW4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nop58Q6DFW4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Nop58Q6DFW4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nop58Q6DFW4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nop58Q6DFW4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nop58Q6DFW4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nop58Q6DFW4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nop58Q6DFW4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nop58Q6DFW4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nop58Q6DFW4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nop58Q6DFW4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nop58Q6DFW4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nop58Q6DFW4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nop58Q6DFW4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Nop58Q6DFW4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nop58Q6DFW4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nop58Q6DFW4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nop58Q6DFW4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nop58Q6DFW4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Nop58Q6DFW4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Nop58Q6DFW4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nop58Q6DFW4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nop58Q6DFW4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Nop58Q6DFW4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nop58Q6DFW4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nop58Q6DFW4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nop58Q6DFW4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nop58Q6DFW4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nop58Q6DFW4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nop58Q6DFW4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nop58Q6DFW4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nop58Q6DFW4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nop58Q6DFW4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Nop58Q6DFW4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nop58Q6DFW4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms