Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdzrn3Q69ZS0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdzrn3Q69ZS0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdzrn3Q69ZS0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pdzrn3Q69ZS0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdzrn3Q69ZS0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pdzrn3Q69ZS0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pdzrn3Q69ZS0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pdzrn3Q69ZS0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pdzrn3Q69ZS0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pdzrn3Q69ZS0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Pdzrn3Q69ZS0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Pdzrn3Q69ZS0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pdzrn3Q69ZS0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pdzrn3Q69ZS0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pdzrn3Q69ZS0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Pdzrn3Q69ZS0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pdzrn3Q69ZS0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pdzrn3Q69ZS0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pdzrn3Q69ZS0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pdzrn3Q69ZS0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdzrn3Q69ZS0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdzrn3Q69ZS0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdzrn3Q69ZS0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdzrn3Q69ZS0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pdzrn3Q69ZS0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pdzrn3Q69ZS0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pdzrn3Q69ZS0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdzrn3Q69ZS0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdzrn3Q69ZS0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdzrn3Q69ZS0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pdzrn3Q69ZS0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pdzrn3Q69ZS0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pdzrn3Q69ZS0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdzrn3Q69ZS0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdzrn3Q69ZS0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdzrn3Q69ZS0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdzrn3Q69ZS0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdzrn3Q69ZS0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdzrn3Q69ZS0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdzrn3Q69ZS0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdzrn3Q69ZS0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdzrn3Q69ZS0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pdzrn3Q69ZS0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pdzrn3Q69ZS0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pdzrn3Q69ZS0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Pdzrn3Q69ZS0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
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