Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Fgd6Q69ZL1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Fgd6Q69ZL1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Fgd6Q69ZL1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Fgd6Q69ZL1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Fgd6Q69ZL1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Fgd6Q69ZL1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Fgd6Q69ZL1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Fgd6Q69ZL1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Fgd6Q69ZL1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Fgd6Q69ZL1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Fgd6Q69ZL1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Fgd6Q69ZL1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Fgd6Q69ZL1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Fgd6Q69ZL1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Fgd6Q69ZL1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Fgd6Q69ZL1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Fgd6Q69ZL1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Fgd6Q69ZL1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Fgd6Q69ZL1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Fgd6Q69ZL1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
Fgd6Q69ZL1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Fgd6Q69ZL1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Fgd6Q69ZL1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Fgd6Q69ZL1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Fgd6Q69ZL1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Fgd6Q69ZL1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
Fgd6Q69ZL1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Fgd6Q69ZL1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Fgd6Q69ZL1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Fgd6Q69ZL1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Fgd6Q69ZL1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Fgd6Q69ZL1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Fgd6Q69ZL1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Fgd6Q69ZL1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Fgd6Q69ZL1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Fgd6Q69ZL1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Fgd6Q69ZL1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Fgd6Q69ZL1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
Fgd6Q69ZL1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
Fgd6Q69ZL1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC33.76■■■■□ 3
Fgd6Q69ZL1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Fgd6Q69ZL1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Fgd6Q69ZL1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Fgd6Q69ZL1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Fgd6Q69ZL1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Fgd6Q69ZL1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Fgd6Q69ZL1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Fgd6Q69ZL1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Fgd6Q69ZL1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Fgd6Q69ZL1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Fgd6Q69ZL1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Fgd6Q69ZL1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Fgd6Q69ZL1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Fgd6Q69ZL1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Fgd6Q69ZL1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Fgd6Q69ZL1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Fgd6Q69ZL1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Fgd6Q69ZL1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Fgd6Q69ZL1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Fgd6Q69ZL1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Fgd6Q69ZL1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Fgd6Q69ZL1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Fgd6Q69ZL1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Fgd6Q69ZL1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Fgd6Q69ZL1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Fgd6Q69ZL1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Fgd6Q69ZL1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Fgd6Q69ZL1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Fgd6Q69ZL1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Fgd6Q69ZL1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Fgd6Q69ZL1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Fgd6Q69ZL1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Fgd6Q69ZL1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Fgd6Q69ZL1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Fgd6Q69ZL1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Fgd6Q69ZL1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Fgd6Q69ZL1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Fgd6Q69ZL1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Fgd6Q69ZL1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Fgd6Q69ZL1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Fgd6Q69ZL1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Fgd6Q69ZL1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Fgd6Q69ZL1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Fgd6Q69ZL1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Fgd6Q69ZL1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Fgd6Q69ZL1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Fgd6Q69ZL1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Fgd6Q69ZL1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Fgd6Q69ZL1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Fgd6Q69ZL1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Fgd6Q69ZL1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Fgd6Q69ZL1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Fgd6Q69ZL1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Fgd6Q69ZL1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Fgd6Q69ZL1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Fgd6Q69ZL1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Fgd6Q69ZL1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Fgd6Q69ZL1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Fgd6Q69ZL1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms