Protein–RNA interactions for Protein: Q68ED3

Papd5, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd5Q68ED3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Papd5Q68ED3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Papd5Q68ED3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Papd5Q68ED3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Papd5Q68ED3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Papd5Q68ED3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Papd5Q68ED3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Papd5Q68ED3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Papd5Q68ED3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Papd5Q68ED3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Papd5Q68ED3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Papd5Q68ED3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Papd5Q68ED3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Papd5Q68ED3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Papd5Q68ED3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Papd5Q68ED3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Papd5Q68ED3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Papd5Q68ED3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Papd5Q68ED3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Papd5Q68ED3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Papd5Q68ED3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Papd5Q68ED3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Papd5Q68ED3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Papd5Q68ED3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Papd5Q68ED3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Papd5Q68ED3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Papd5Q68ED3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms