Protein–RNA interactions for Protein: Q64318

Zeb1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb1Q64318 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Zeb1Q64318 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Zeb1Q64318 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Zeb1Q64318 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Zeb1Q64318 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Zeb1Q64318 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Zeb1Q64318 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Zeb1Q64318 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Zeb1Q64318 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Zeb1Q64318 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Zeb1Q64318 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Zeb1Q64318 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Zeb1Q64318 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Zeb1Q64318 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Zeb1Q64318 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Zeb1Q64318 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Zeb1Q64318 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Zeb1Q64318 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Zeb1Q64318 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Zeb1Q64318 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Zeb1Q64318 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Zeb1Q64318 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Zeb1Q64318 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Zeb1Q64318 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Zeb1Q64318 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Zeb1Q64318 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Zeb1Q64318 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Zeb1Q64318 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Zeb1Q64318 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Zeb1Q64318 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Zeb1Q64318 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Zeb1Q64318 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Zeb1Q64318 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Zeb1Q64318 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Zeb1Q64318 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Zeb1Q64318 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Zeb1Q64318 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Zeb1Q64318 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Zeb1Q64318 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Zeb1Q64318 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Zeb1Q64318 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Zeb1Q64318 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Zeb1Q64318 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Zeb1Q64318 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Zeb1Q64318 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Zeb1Q64318 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Zeb1Q64318 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Zeb1Q64318 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Zeb1Q64318 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Zeb1Q64318 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Zeb1Q64318 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Zeb1Q64318 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Zeb1Q64318 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Zeb1Q64318 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Zeb1Q64318 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Zeb1Q64318 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Zeb1Q64318 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Zeb1Q64318 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Zeb1Q64318 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Zeb1Q64318 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Zeb1Q64318 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Zeb1Q64318 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Zeb1Q64318 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Zeb1Q64318 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Zeb1Q64318 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Zeb1Q64318 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Zeb1Q64318 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Zeb1Q64318 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Zeb1Q64318 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Zeb1Q64318 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Zeb1Q64318 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Zeb1Q64318 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Zeb1Q64318 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Zeb1Q64318 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Zeb1Q64318 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Zeb1Q64318 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Zeb1Q64318 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Zeb1Q64318 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Zeb1Q64318 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Zeb1Q64318 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Zeb1Q64318 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Zeb1Q64318 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Zeb1Q64318 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Zeb1Q64318 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Zeb1Q64318 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Zeb1Q64318 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Zeb1Q64318 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Zeb1Q64318 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Zeb1Q64318 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Zeb1Q64318 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Zeb1Q64318 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Zeb1Q64318 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Zeb1Q64318 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Zeb1Q64318 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Zeb1Q64318 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Zeb1Q64318 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Zeb1Q64318 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Zeb1Q64318 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Zeb1Q64318 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Zeb1Q64318 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms